Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Snx27Q3UHD6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Snx27Q3UHD6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms