Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfgef3Q3UGY8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfgef3Q3UGY8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms