Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trip13Q3UA06 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trip13Q3UA06 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms