Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf180Q3U827 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf180Q3U827 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf180Q3U827 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf180Q3U827 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf180Q3U827 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rnf180Q3U827 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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Rnf180Q3U827 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Rnf180Q3U827 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Rnf180Q3U827 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Rnf180Q3U827 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Rnf180Q3U827 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Rnf180Q3U827 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Rnf180Q3U827 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Rnf180Q3U827 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Rnf180Q3U827 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rnf180Q3U827 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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