Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Ssbp4Q3U4B1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Ssbp4Q3U4B1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
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