Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ulk3Q3U3Q1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ulk3Q3U3Q1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms