Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf149Q3U2C5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rnf149Q3U2C5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rnf149Q3U2C5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rnf149Q3U2C5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rnf149Q3U2C5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rnf149Q3U2C5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rnf149Q3U2C5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Rnf149Q3U2C5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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