Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CiartQ3TQ03 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CiartQ3TQ03 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms