Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
XylbQ3TNA1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.05■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.05■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
XylbQ3TNA1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms