Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccdc102aQ3TMW1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms