Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Smarca4Q3TKT4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smarca4Q3TKT4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms