Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdlim7Q3TJD7 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdlim7Q3TJD7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdlim7Q3TJD7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdlim7Q3TJD7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdlim7Q3TJD7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdlim7Q3TJD7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdlim7Q3TJD7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Pdlim7Q3TJD7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdlim7Q3TJD7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdlim7Q3TJD7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdlim7Q3TJD7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdlim7Q3TJD7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Pdlim7Q3TJD7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pdlim7Q3TJD7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms