Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Stt3bQ3TDQ1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Stt3bQ3TDQ1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms