Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tmem248Q3TBN1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem248Q3TBN1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms