Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Hddc2Q3SXD3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hddc2Q3SXD3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms