Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Riiad1Q3KNY5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Riiad1Q3KNY5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms