Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rspo3Q2TJ95 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rspo3Q2TJ95 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms