Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Samd11Q1RNF8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Samd11Q1RNF8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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