Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trim71Q1PSW8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trim71Q1PSW8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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