Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cd300lgQ1ERP8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms