Protein–RNA interactions for Protein: Q14CH0

Fam171b, Protein FAM171B, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam171bQ14CH0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Fam171bQ14CH0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms