Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rpusd2Q149F1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd2Q149F1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms