Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Traf3ip1Q149C2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3ip1Q149C2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3ip1Q149C2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3ip1Q149C2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3ip1Q149C2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3ip1Q149C2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3ip1Q149C2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3ip1Q149C2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3ip1Q149C2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3ip1Q149C2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3ip1Q149C2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3ip1Q149C2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3ip1Q149C2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3ip1Q149C2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Traf3ip1Q149C2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms