Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc162pQ0VG85 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms