Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp2b3Q0VF55 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp2b3Q0VF55 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms