Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TrioQ0KL02 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TrioQ0KL02 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms