Protein–RNA interactions for Protein: Q0KK55

Kndc1, Protein very KIND, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kndc1Q0KK55 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Kndc1Q0KK55 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Kndc1Q0KK55 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms