Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
1700061G19RikQ08EE8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
1700061G19RikQ08EE8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms