Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cass4Q08EC4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cass4Q08EC4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms