Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q08AU9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q08AU9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q08AU9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q08AU9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Q08AU9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q08AU9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Q08AU9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Q08AU9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q08AU9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q08AU9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q08AU9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q08AU9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Q08AU9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q08AU9 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q08AU9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q08AU9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q08AU9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q08AU9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q08AU9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q08AU9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q08AU9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Q08AU9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q08AU9 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q08AU9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q08AU9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms