Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Gata4Q08369 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms