Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CbfbQ08024 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CbfbQ08024 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms