Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col9a2Q07643 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Col9a2Q07643 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms