Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Col17a1Q07563 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Col17a1Q07563 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col17a1Q07563 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col17a1Q07563 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col17a1Q07563 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Col17a1Q07563 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col17a1Q07563 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col17a1Q07563 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col17a1Q07563 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col17a1Q07563 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col17a1Q07563 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Col17a1Q07563 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col17a1Q07563 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col17a1Q07563 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col17a1Q07563 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Col17a1Q07563 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col17a1Q07563 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Col17a1Q07563 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms