Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cdx4Q07424 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cdx4Q07424 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms