Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntn3Q07409 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms