Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gdf3Q07104 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gdf3Q07104 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms