Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox4Q06831 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sox4Q06831 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms