Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Col9a1Q05722 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Col9a1Q05722 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms