Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sox13Q04891 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms