Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sox9Q04887 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sox9Q04887 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms