Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Top1Q04750 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top1Q04750 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top1Q04750 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top1Q04750 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Top1Q04750 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Top1Q04750 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms