Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Emx2Q04744 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Emx2Q04744 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms