Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RelaQ04207 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelaQ04207 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelaQ04207 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelaQ04207 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelaQ04207 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RelaQ04207 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms