Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thbs2Q03350 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms