Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gjb4Q02738 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms