Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RykQ01887 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
RykQ01887 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RykQ01887 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RykQ01887 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RykQ01887 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RykQ01887 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RykQ01887 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RykQ01887 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RykQ01887 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RykQ01887 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RykQ01887 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RykQ01887 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RykQ01887 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RykQ01887 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RykQ01887 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RykQ01887 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RykQ01887 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms