Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gbp1Q01514 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbp1Q01514 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms