Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Col1a2Q01149 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Col1a2Q01149 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms