Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Grin2bQ01097 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Grin2bQ01097 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms